Title
Diversity of methicillin-resistant coagulase-negative Staphylococcus spp. and methicillin-resistant Mammaliicoccus isolated from ruminants and New World camelids
Language
English
Description (de)
Dissertation - Veterinärmedizinische Universität Wien - 2021
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Description (en)
Dissertation - University of Veterinary Medicine Vienna - 2021
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Description (en)
The information about livestock carrying methicillin-resistant coagulase-negative staphylococci and mammaliicocci (MRCoNS/MRM) in Austria is scarce. The study aimed to gain knowledge of the prevalence, the phenotypic and genotypic antimicrobial resistance pattern, and the genetic diversity of identified MRCoNS/MRM originating from ruminants and New World camelids kept in Austria. A multi-locus sequence typing scheme (MLST) for the characterization of Mammaliicoccus (formerly Staphylococcus) sciuri was developed. The study was conducted at the University Clinic for Ruminants and the Institute of Microbiology at the University of Veterinary Medicine Vienna. Nasal swabs from seven hundred twentythree ruminants and New World camelids with and without clinical signs were examined. After isolation, MRCoNS/MRM were identified by MALDI-TOF, rpoB sequencing and typed by DNA microarray-based analysis and PCR. Antimicrobial susceptibility testing was performed by agar disk diffusion. 189 MRCoNS/MRM isolates were detected from all 723 nasal swabs. Members of the Mammaliicoccus (M.) sciuri group were predominant (M. sciuri (n=130), followed by M. lentus (n=43), M. fleurettii (n=11)). Furthermore Staphylococcus haemolyticus was detected (n=5). Out of the 189 detected isolates, 158 showed a multiresistant phenotype. For M. sciuri was a seven-loci multi-locus sequence typing scheme developed. The scheme includes the analysis of internal segments of the house-keeping genes acetate kinase (ack), shikimate 5-dehydrogenase (aroE), cell division protein (ftsZ), gluconokinase (glpK), guanylate kinase (gmk), phosphate butyryltransferase (pta1) and triosephosphate isomerase (tpiA). Among the 92 selected M. sciuri isolates, 28 different sequence types (STs) were identified. ST1 was the most prevalent ST (n=35), followed by ST 2 (n=15), ST3 and ST5 (each n=5), ST4 (n=3), ST6, ST7, ST8, ST9, ST10 and ST11 (each n=2).
Description (de)
In Österreich gibt es nur wenig Informationen über Methicillin-resistente Koagulasenegativen Staphylokokken und Mammalikokken (MRCoNS / MRM) bei Nutztieren. Ziel dieser Studie war es, Kenntnisse über das Vorkommen, die Prävalenz sowie die phänotypischen-, genotypischen und antimikrobiellen Resistenzmuster und deren genetischen Vielfalt von identifizierten MRCoNS / MRM von in Österreich gehaltenen Wiederkäuern und Neuweltkamelen zu gewinnen. Des Weiteren wurde ein Multi-Locus-Sequenz- Typisierungsschema zur Charakterisierung von Mammaliikokkus (früher Staphylokokkus) sciuri entwickelt. Die Proben wurden an der Universitätsklinik für Wiederkäuer entnommen und die weiteren Untersuchungen fanden dann am Institut für Mikrobiologie der Veterinärmedizinischen Universität Wien statt. Insgesamt wurden 723 Nasentupfer von Wiederkäuern und Neuweltkameliden (Lama und Alpakas) genommen welche als Patienten oder als Begleittiere von Patienten an der Klinik behandelt wurden. Nach erfolgter Erregerisolierung wurden die MRCoNS / MRM Isolate mittels MALDI-TOF, rpoBSequenzierung identifiziert und durch eine DNA-Microarray-basierten Analyse sowie PCR’s typisiert. Die Sensibilitätsprüfung auf antimikrobiell wirksame Substanzen wurde mittel Agar-Diffusionstest durchgeführt. Insgesamt konnten aus 723 Nasentupfer 189 MRCoNS / MRM Isolate nachgewiesen werden. Mitglieder der Mammaliikokkus (M.) sciuri-Gruppe waren dominant (M. sciuri (n=130), gefolgt von M. lentus (n=43) und M. fleurettii (n=11)), außerdem wurde Staphylokokkus haemolyticus (n=5) nachgewiesen. Es wurden insgesamt 158 von 189 Isolaten als Multi-resistent eingestuft. Multi-Lokus-Sequenzierungsschema für M. sciuri wurde entwickelt, in welchen sieben Loci verwendet werden. Das Schema umfasst die Analyse interner Segmente der sieben Haushaltsgene acetate kinase (ack), shikimate 5- dehydrogenase (aroE), cell division protein (ftsZ), gluconokinase (glpK), guanylate kinase (gmk), phosphate butyryltransferase (pta1) und triosephosphate isomerase (tpiA). Für die Entwicklung wurden 92 M. sciuri Isolate ausgewählt, in Summe konnten 28 verschiedene Sequenztypen(STs) identifiziert werden. ST1 war der am häufigsten detektierte ST (n=35), gefolgt von ST2 (n=15), ST3 und ST5 (n=5), ST4 (n=3), ST6, ST7, ST8, ST9. ST10 und ST11 (jeweils n=2).
AC-Number
AC16470344
Author of the digital object
Bernhard Schauer
Adviser
Reinhild Krametter-Frötscher
Adviser
Joachim Spergser
Assessor
Igor Loncaric
Co-advisor
Frank Künzel
Format
application/pdf
Size
2.7 MB
Licence Selected
All rights reserved
Type of publication
Dissertation
Date of approbation period
2021
Pages or Volume
70 Blätter
Publication Date
2021
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Persistent identifier
https://phaidra.vetmeduni.ac.at/o:1028
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AC16470344
Restricted access
Details
Object type
PDFDocument
Format
application/pdf
Created
07.04.2022 08:20:27
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