Diplomarbeit - Veterinärmedizinische Universität Wien - 2021

Ein großer Teil des Y-Chromosoms rekombiniert während der Meiose nicht. Das bedeutet, es wird fast unverändert von Generation zu Generation vom Vater an den Sohn weitergegeben. Mutationen am Y-Chromosom können somit als Marker verwendet werden, um väterliche Genealogien zu rekonstruieren. In dieser Arbeit wurden Nordafrikanische Pferde der Rassen Berber, Araber-Berber und Pony von Mogod auf ihr Y-chromosomales Haplotypenspektrum untersucht und die väterlichen Ursprünge dieser Pferderassen beleuchtet. Die verwendeten Proben dieser Arbeit stammen von 130 männlichen Pferden von Berbern, Araber-Berbern und dem Pony von Mogod. Die genomische DNA der Tiere wurde aus Haarwurzelzellen isoliert. Die Untersuchung auf Y-chromosomale Haplotypen erfolgte durch Allelbestimmungen an 62 Y-chromosomalen Markern. Die Genotypisierung der Marker wurde mittels fluoreszierender KASP™-Technologie durchgeführt. Basierend auf den Ergebnissen wurden die Haplotypen der untersuchten Proben rekonstruiert und die Haplotypenstruktur als phylogenetischer Stammbaum dargestellt. Alle untersuchten Proben wurden der etwa 1500 Jahre alten Kronhaplogruppe zugeordnet. Kronhaplogruppe A stellte mit 85 Proben den dominantesten Zweig dar. Die Kronhaplogruppe H wies 35, die Kronhaplogruppe T 10 Proben auf. Insgesamt wurden 19 verschiedene Haplotypen detektiert. Es wurde gezeigt, dass das Nordafrikanische Pferd eine ausgeprägte Y-chromosomale Haplotypenvielfalt aufweist. Klare Unterschiede zwischen Berbern und Araber-Berbern konnten durch Y-chromosomale Analysen nicht festgestellt werden. Die Variabilität der Haplotypen im Nordafrikanischen Pferd ist viel ausgeprägter als bei anderen Pferderassen. Weiters wird aus den Ergebnissen ersichtlich, dass die Haplotypendiversität des Nordafrikanischen Pferdes aufgrund technischer Limitierungen noch unterschätzt wird. Zusammenfassend lässt sich an dieser Stelle nochmals betonen, dass die ausgeprägte Y-chromosomale Haplotypenvielfalt des Nordafrikanischen Pferdes auf die Besonderheit dieser Pferdepopulationen hinweist.

The male specific part of the Y-chromosome does not recombine during meiosis. This means that it is passed on almost unchanged from father to son from generation to generation. Mutations on the Y chromosome can thus be used as markers to reconstruct paternal genealogies. In this study, North African horses of the breeds Barb, Arab-Barb and Pony of Mogod were examined for their Y-chromosomal haplotype spectrum and the paternal origins of these horse breeds were illuminated. The study is based on genomic DNA of 130 male Barb, Arab-Barb and Pony of Mogod horses. The DNA of the animals was isolated from hair root samples. The investigation for Y-chromosomal haplotypes was carried out by allele determinations on 62 Y-chromosomal markers. Genotyping of the markers was performed with Fluorescent KASP™ technology. Based on the results, the haplotypes of the examined samples were reconstructed and the haplotype structure represented as a phylogenetic tree. All samples examined were assigned to the approximately 1500 year old crown haplogroup. Haplogroup A represented the most dominant branch with 85 samples. Haplogroup H had 35, and haplogroup T 10 samples. A total of 19 different haplotypes were detected. It has been shown that the North African horse has distinctive Y-chromosomal haplotype diversity. Clear differences between Barbs and Arab-Barbs could not be determined by Y-chromosomal analyzes. The variability of haplotypes in the North African horse is much more pronounced than in other horse breeds. The results also show that the haplotype diversity of the North African horse is still underestimated due to technical limitations. In summary, it can be emphasized that the large Y-chromosomal haplotype diversity of the North African horse shows the distinctiveness of these populations.

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