Diplomarbeit - Veterinärmedizinische Universität Wien - 2022

Das Porzine Circovirus 2, das 1974 das erste Mal isoliert werden konnte, gilt als Haupterreger der Porzinen Circovirose und als eines der relevantesten Viren in der Schweinemedizin. Auch das 2016 neu entdeckte Porzine Circovirus 3 wird verantwortlich gemacht die typischen Krankheitsbilder einer Porzinen Circovirose auslösen zu können, wenn das PCV2 selbst durch eine PCR nicht nachweisbar ist. Aus diesem Grund ist es sinnvoll, Duplex- beziehungsweise Multiplex-qPCR zu etablieren, die zeit- und kostensparend das Vorhandensein mehrerer Viren gleichzeitig überprüfen können. Ziel dieser Arbeit war es, eine solche Duplex-qPCR zum Nachweis PCV2- und PCV3-spezifischer Nukleinsäuren zu etablieren und retrospektiv die Prävalenz von PCV3 in österreichischen Schweinen einzuschätzen. Dazu wurden Sonden und Standards auf ihre Funktion überprüft und die Nachweisgrenze der Monoplex-qPCR mit den Nachweisgrenzen der Duplex-qPCR verglichen. Ergänzend wurden im Anschluss Feldproben getestet, um sowohl Praxistauglichkeit und Zuverlässigkeit, als auch geeignetes Probenmaterial zu verifizieren. Die Untersuchungen haben gezeigt, dass die Duplex-qPCR mit vergleichbaren Nachweisgrenzen die Viren detektieren und voneinander unterscheiden kann. PCV3 ist in Österreich prävalent. Probenmaterialentnahmen sollten aus den Organsystemen erfolgen, die klinisch auffällig sind. Diese können neben deutlich vergrößerten Lymphknoten eine schlecht retrahierte Lunge mit bräunlichen Verfärbungen und eine verfärbte Leber sein oder multifokale Verfärbungen des Myokards bei Totgeburten oder mumifizierten Föten. Einzig Serum scheint aufgrund der kurzen Virämie kein geeignetes Material für die PCR zu sein.

Porcine circovirus 2 (PCV2), which was isolated for the first time in 1974, is considered as the main pathogenic agent that causes porcine circovirosis and is also known as one of the most important viruses in swine medicine. In 2016 the new virus PCV3 was detected, which may cause a characteristic disease pattern primarily known for PCV2, although PCV2 could not be detected. Therefore developing duplex- or multiplex PCRs for detecting different infectious agents simultaneously in one sample is indicated, to save money and time. The aim of this project was to evaluate such a new duplex-PCR to detect PCV2- and PCV3-nucleic acids and to estimate the prevalence of PCV3 in austrian pigs retrospectively. For this reason, probes and standards were verified regarding their function and PCR detection limit were compared. Afterwards field samples were used to verify the reliability and suitability for routine use and to find out which material is the most suitable. It was shown that the duplex qPCR could detect and differentiate the viruses with similar detection limit, compared to the monoplex-qPCR. PCV3 is prevalent in Austria and samples should be taken from organ systems that present with pathologic signs. This could be enlarged lymph nodes, a badly retracted lung, a discolored liver or multifocal discolorations of the myocard in aborted piglets. Serum samples were all negative, except for one. Therefore serum seems not being a matrix for reliably detect PCV3 in infected animals.

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