Diploma thesis - University of Veterinary Medicine Vienna - 2021

Very little is known about the evolutionary history and the influence of other horse breeds on autochthonous breeds in Armenia, Georgia, Greece, Iran and Turkmenistan. In this study the paternal history of horses from those countries was investigated. The male specific part of the Y chromosome (MSY) does not recombine and accordingly the father’s MSY region is directly passed on to the male descendants. The MSY is therefore ideal to genetically study the breeding influence of males . Within this thesis, MSY haplotypes from 153 samples of male horses from the Caucasus region, Western Asia and Greece were determined. The samples were gathered from horses belonging to autochthonous breeds like the Akhal Teke, the Andravida Horse, the Armenian Horse, the Caspian Miniature Horse, the Creta Pony, the Kurd Horse, the Lesvos Pony, the Peneia Pony, the Pindos Pony, the Rodos Small Horse, the Skyros Pony, the Thessalian Pony, the Turkoman and the Tushuri. 45 different Y chromosomal markers were analysed to determine the specific haplotype of the samples, using fluorescent competitive allele specific polymerase chain reaction (KASP® PCR) or QIAxcel® Advanced System and ABI 3130xl Genetic Analyzer. 126 of the 153 DNA samples were assigned to a haplotype within the Crown haplogroup, the predominant haplogroup in modern horses. Within the Crown Group, 36 samples were allocated to the haplogroup A, 89 to haplogroup T and one sample could not be grouped inside any of the previously known haplotypes already described Crown haplogroups. 27 samples from Greek islands did not cluster into the Crown haplogroup. This was the first detection of haplotpyes outside the Crown in Southern Europe. The results show on the one hand, the influence of recent breeding with Thoroughbreds and Arabians in the autochthonous breeds investigated. On the other hand, the results show that MSY haplotype diversity in autochthonous horse breeds in the European Asian border region is still higher than in modern day breeds.

Diplomarbeit - Veterinärmedizinische Universität Wien - 2021

Über die Evolutionsgeschichte und den Einfluss anderer Pferderassen auf autochthone Rassen in Armenien, Georgien, Griechenland, Iran und Turkmenistan ist sehr wenig bekannt. Im Rahmen dieser Arbeit wurde die Geschichte dieser autochtonen Pferderassen mithilfe paternaler Marker untersucht. Der spezifisch männliche Teil des Y-Chromosoms (MSY) rekombiniert nicht und folglich wird die MSY-Region des Vaters direkt an die männlichen Nachkommen weitergegeben. Die MSY ist daher ideal, um den Zuchteinfluss von Hengsten genetisch zu untersuchen. Im Rahmen dieser Arbeit wurden MSY-Haplotypen von 153 Proben männlicher Pferde aus der Kaukasusregion, Westasien und Griechenland bestimmt. Die Proben stammen von Pferden, die zu autochthonen Rassen wie dem Achal-Tekkiner, dem Andravida Pferd, dem Armenischen Pferd, dem Kaspischen Kleinpferd, dem Kretanischen Pferd, dem Kurdischen Halbblut, dem Mindili Pferd, dem Peneia-Pony, dem Pindos-Pony, dem Rhodos Miniaturpferd, dem Skyros-Pony, dem Thessalischen Pony, dem Turkmenen und dem Tushuri gehören. 45 verschiedene Y-chromosomale Marker wurden analysiert, um den spezifischen Haplotyp der Proben zu bestimmen. Dazu wurde die fluoreszierende kompetitive allelspezifische Polymerase-Kettenreaktion (KASP® PCR), QIAxcel® Advanced System oder ABI 3130xl Genetic Analyzer verwendet. 126 der 153 DNA-Proben konnten einem Haplotyp innerhalb der Kron-Haplogruppe, der vorherrschenden Haplogruppe bei modernen Pferderassen, zugeordnet werden. Innerhalb der Krongruppe gehörten 36 Proben der Haplogruppe A und 89 der Haplogruppe T an. Eine Probe konnte keinem der bisher beschriebenen Haplotypen der Krongruppe zugeordnet werden. 27 Proben von den griechischen Inseln ließen sich nicht in die Kron-Haplogruppe einordnen. Dies war der erste Nachweis von Haplotpyen außerhalb der Krongruppe in Südeuropa. Die Ergebnisse zeigen einerseits den Einfluss der rezenten Zucht mit Vollblütern und Arabern auf die untersuchten autochthonen Rassen. Andererseits zeigen die Resultate, dass die MSY- Haplotypen-Diversität in autochthonen Pferderassen im europäisch-asiatischen Grenzgebiet immer noch höher ist als bei modernen Sport- und Freizeitpferden.

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125 Blätter