Diplomarbeit - Veterinärmedizinische Universität Wien - 2022

Über den Einfluss von Gefangenschaft auf die mikrobielle Flora des europäischen Ziesels ist wenig bekannt. Stress, veränderte Ernährung und Haltungsbedingungen können einen Anstieg pathogener Erreger begünstigen. Ziel dieser Diplomarbeit ist es die Auswirkungen einer Quarantäne auf die mikrobielle Flora zu untersuchen. Im Rahmen eines Translokationsprojektes wurden gefangene Ziesel zum Fangzeitpunkt sowie nach durchschnittlich 15 Tagen beprobt. Untersucht wurden Speichelproben auf mikrobiologische, sowie virale, und Kotproben auf mikrobiologische und parasitologische Pathogene. Die mikrobiologische Untersuchung erfolgte mittels kulturellem Erregernachweis, dem MALDI-ToF-Verfahren und 16S-rRNA-Gen-Analyse. Die virologische Untersuchung erfolgte mittels PCR, die parasitologische mittels Kotflotation. Insgesamt wurden 65 Zieseln eingeschlossen. Der Nachweis von Bordetella bronchiseptica und Mycoplasma sp. fuhrte zum Ausschluss. Im Speichel konnten 26 Mikroorganismen der Stamme Firmicutes, Proteobacteria, Actinobacteria und Ascomycota nachgewiesen werden. Bei Firmicutes species wurde ein Ruckgang und bei Proteobacteria ein Anstieg verzeichnet, wobei auf Speziesebene Neisseria sp. signifikant ab- und Bibersteinia trehalosi signifikant zunahm. Die mikrobiologische Kotuntersuchung ergab eine Zunahme von Arten der Stamme Firmicutes und Bacteroidetes sowie eine Abnahme von Proteobacteria und Ascomycota, wobei auf Speziesebene Staphylococcus microti und Bacteroides sp. signifikant zunahmen. Die parasitologischen Untersuchung ergab eine geringe Abnahme von Coccidea sp. . Die virologischen Untersuchungen blieben negativ. Diese Arbeit konnte deutliche Veränderungen der bakteriellen und parasitologischen Flora in Quarantäne nachweisen. Erstmals wurden beim europäischen Ziesel Bordetella bronchiseptica nachgewiesen. Inwiefern andere Einflussfaktoren wie z.B. die Jahreszeit im Hinblick auf die Veränderungen der mikrobiellen Flora eine Rolle spielen und welche Auswirkungen diese einen Einfluss auf den Gesundheitszustand der Ziesel haben sollte in weiteren Studien untersucht werden.

Little is known about the impact of captivity on the microbial flora of the European ground squirrel. Stress, altered diet, and housing conditions can promote an increase in pathogens. The aim of this thesis is to investigate the effects of quarantine on the microbial flora. As part of a translocation project, captive ground squirrels were sampled at the time of capture and after an average of 15 days. Saliva samples were examined for microbiological, as well as viral, and fecal samples for microbiological and parasitological pathogens. Microbiological testing was performed using cultural pathogen detection, the MALDI-ToF method, and 16S-rRNA analysis. Virological examination was performed by PCR, and parasitological examination was performed by fecal flotation. A total of 65 animals were included. Detection of Bordetella bronchiseptica and Mycoplasma sp. led to exclusion. In buccal swabs, 26 species of Firmicutes, Proteobacteria, Actinobacteria and Ascomycetes strains were detected. A decrease was recorded in Firmicutes species and an increase in Proteobacteria, with a significant decrease in Neisseria sp. and a significant increase in Bibersteinia trehalosi at the species level. Microbiological fecal examination revealed an increase in species of Firmicutes and Bacteroidetes strains and a decrease in Proteobacteria and Ascomycota, with significant increases in Staphylococcus microti and Bacteroides sp. at the species level. Parasitological examination showed a slight decrease in Coccidea sp. . The virological examinations remained negative. This study was able to demonstrate considerate changes in bacterial and parasitological flora in quarantine. For the first time, Bordetella bronchiseptica was detected in the European ground squirrel. The extent to which other influencing factors, such as the season, play a role in the changes of the microbial flora and what effects these have on the health status of the animals should be investigated in further studies.

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48 Blätter