{"@context":{"aiiso":"http:\/\/purl.org\/vocab\/aiiso\/schema#","arm":"https:\/\/ld4p.github.io\/arm\/core\/ontology\/0.1\/","bf":"http:\/\/id.loc.gov\/ontologies\/bibframe\/","bib":"https:\/\/bibliotek-o.org\/","bibo":"http:\/\/purl.org\/ontology\/bibo\/","cito":"http:\/\/purl.org\/spar\/cito\/","classSchemes":"http:\/\/id.loc.gov\/vocabulary\/classSchemes","dbo":"http:\/\/dbpedia.org\/ontology\/","dce":"http:\/\/purl.org\/dc\/elements\/1.1\/","dcmitype":"http:\/\/dublincore.org\/documents\/2000\/07\/11\/dcmi-type-vocabulary\/#","dcterms":"http:\/\/purl.org\/dc\/terms\/","ebucore":"http:\/\/www.ebu.ch\/metadata\/ontologies\/ebucore\/ebucore#","edm":"http:\/\/www.europeana.eu\/schemas\/edm\/","foaf":"http:\/\/xmlns.com\/foaf\/0.1\/","frap":"http:\/\/purl.org\/cerif\/frapo\/","identifiers":"http:\/\/id.loc.gov\/vocabulary\/identifiers\/","ids":"http:\/\/id.loc.gov\/vocabulary\/identifiers\/","oaire":"http:\/\/namespace.openaire.eu\/schema\/oaire\/","oefos2012":"https:\/\/vocabs.acdh.oeaw.ac.at\/oefosdisciplines\/","opaque":"http:\/\/opaquenamespace.org\/","pcdm":"http:\/\/pcdm.org\/models#","phaidra":"https:\/\/phaidra.org\/ontology\/","rdam":"http:\/\/rdaregistry.info\/Elements\/m\/","rdau":"http:\/\/rdaregistry.info\/Elements\/u\/","rdax":"http:\/\/rdaregistry.info\/Elements\/x\/","rdf":"http:\/\/www.w3.org\/1999\/02\/22-rdf-syntax-ns#","rdfs":"http:\/\/www.w3.org\/2000\/01\/rdf-schema#","relators":"http:\/\/id.loc.gov\/vocabulary\/relators\/","role":"http:\/\/id.loc.gov\/vocabulary\/relators\/","role:assessor":{"@container":"@list","@id":"http:\/\/id.loc.gov\/vocabulary\/relators\/assessor"},"role:aut":{"@container":"@list","@id":"http:\/\/id.loc.gov\/vocabulary\/relators\/aut"},"role:coadvisor":{"@container":"@list","@id":"http:\/\/id.loc.gov\/vocabulary\/relators\/coadvisor"},"role:dgs":{"@container":"@list","@id":"http:\/\/id.loc.gov\/vocabulary\/relators\/dgs"},"schema":"http:\/\/schema.org\/","skos":"http:\/\/www.w3.org\/2004\/02\/skos\/core#","skosxl":"http:\/\/www.w3.org\/2008\/05\/skos-xl#","vra":"http:\/\/purl.org\/vra\/"},"@id":"https:\/\/phaidra.vetmeduni.ac.at\/o:4731","bf:note":[{"@type":"bf:Note","skos:prefLabel":[{"@language":"eng","@value":"Bachelor thesis - University of Veterinary Medicine Vienna - 2024"}]},{"@type":"bf:Summary","skos:prefLabel":[{"@language":"eng","@value":"Among women, breast cancer is the type of cancer with the highest mortality and incidence.Despite treatment with a combination of therapies and surgery patients often show signs ofincomplete response and eventual relapse. Lately a temporary state of drug resistance knownas drug tolerant persistence was found. Those so-called drug-tolerant persister (DTP) cellsand their mechanisms require further research.Currently, it is not known whether DTP cells are randomly selected for survival or are derivedfrom a pre-determined sub-population of drug-naive cells, and whether such “pre-DTP” cellswould be clonally determined. To address these possibilities in in vitro experiments, this thesisassessed an experimental setup using lentiviral tagging of cells and so-called repopulationassays where modeling acute drug response induces the DTP state. It was shown that 250 nMfor MCF-7 cells and 125 nM of doxorubicin for CSTr cells was the best concentration to inducethe DTP state. CSTr cells were shown to repopulate after about two weeks while MCF-7 cellstook in average approximately five weeks.Several genes are believed to be involved in the phenotypic transition. Their functionalrelevance can be assessed in knockdown experiments requiring two cell lines with differentfluorescent tags to distinguish cells with and without gene expression. This thesis tested if theintroduction of red and green fluorescent proteins drastically influences drug sensitivity ofMCF-7 cells, time of dormancy of DTP-cells and whether there is a selection for either one ofthe cell types when running repopulation assays. It was found that MCF-7 cells with twodifferent fluorescent proteins show similar drug sensitivity and that the time until repopulationis not significantly different. Moreover, it was shown that the ratio of RFP+ and GFP+ cellsdoes not drastically change over time, thus allowing planned knockdown experiments."}]},{"@type":"bf:Note","skos:prefLabel":[{"@language":"deu","@value":"Bachelorarbeit - Veterinärmedizinische Universität Wien - 2024"}]},{"@type":"bf:Summary","skos:prefLabel":[{"@language":"deu","@value":"Brustkrebs ist unter weiblichen Patienten jener Typ Krebs mit sowohl der höchsten Mortalitätals auch Inzidenz. Trotz der Behandlung mit einer Kombination von Therapien und Operation sprechen Patienten oft nicht vollständig auf diese an und erkranken eventuell erneut. Kürzlich wurde ein vorrübergehender Zustand der Arzneimittelresistenz, bekannt als arzneimitteltolerante Persistenz (DTP), entdeckt. Diese sogenannten DTP-Zellen und ihre Mechanismen erfordern weitere Forschung. Derzeit ist es unbekannt, ob DTP-Zellen zufällig zum Überleben ausgewählt werden oder ob sie aus einer vorbestimmten Subpopulation unbehandelter Krebszellen stammen und ob solche „Prä-DTP“-Zellen klonal bestimmt werden. Um diese Möglichkeiten in in vitro Experimenten zu testen, wurde in dieser Arbeit ein Versuchsaufbau, basierend auf dem lentiviralen Markieren von Zellen und auf sogenannten Repopulationstests, in welchen der DTP-Zustand durch Modellierung einer akuten Arzneimittelreaktion hervorgerufen wird, entwickelt. Es wurde gezeigt, dass 250 nM für MCF-7 Zellen und 125 nM Doxorubicin für CSTrZellen die besten Konzentrationen sind, um den Zustand der Arzneimittelresistenz zuinduzieren. Während CSTr Zellen bereits nach rund zwei Wochen Repopulation vorweisen konnten, brauchten die MCF-7 Zellen etwa fünf Wochen dafür. Es wird vermutet, dass gewisse Gene an diesem phänotypischen Übergang beteiligt sind. Die funktionelle Relevanz der Gene kann in Knockdown-Experimenten ermittelt werden, welche zwei mit verschiedenen fluoreszenten Proteinen markierte Zelllinien erfordern, um Zellen mit und ohne Genexpression voneinander zu unterschieden. In dieser Arbeit wurde untersucht, ob durch die Expression dieser fluoreszierenden Proteine die Empfindlichkeit der Zellengegenüber Arzneimitteln und die Dauer der Ruhephase der DTP-Zellen drastisch beeinflusst und ob in Repopulationstests eine Selektion für einen der beiden Zelltypen stattfindet. Es wurde festgestellt, dass MCF-7 Zellen mit zwei verschiedenen fluoreszierenden Proteinen eine ähnliche Empfindlichkeit gegenüber Arzneimitteln aufweisen und, dass die Zeit bis zur Repopulation sich nicht signifikant unterschiedet. Außerdem wurde gezeigt, dass das Verhältnis von RFP+ und GFP+ MCF7 Zellen sich über die Zeit nicht drastisch verändert, was zukünftige Knockdown-Experimente ermöglicht."}]}],"dce:title":[{"@type":"bf:Title","bf:mainTitle":[{"@language":"eng","@value":"Establishing in vitro systems addressing the clonality of drug tolerant persister cells"}]}],"dcterms:issued":["2024"],"dcterms:language":["eng"],"dcterms:type":[{"@type":"skos:Concept","skos:exactMatch":["https:\/\/pid.phaidra.org\/vocabulary\/69ZZ-2KGX"],"skos:prefLabel":[{"@language":"eng","@value":"Text"},{"@language":"deu","@value":"Text"},{"@language":"ita","@value":"Testo"}]}],"ebucore:filename":["vuwAC17685061.pdf"],"ebucore:hasMimeType":["application\/pdf"],"edm:hasType":[{"@type":"skos:Concept","skos:exactMatch":["https:\/\/pid.phaidra.org\/vocabulary\/Z3K6-SWVD"],"skos:prefLabel":[{"@language":"eng","@value":"Bachelor theses"},{"@language":"deu","@value":"Bachelorarbeit"},{"@language":"ita","@value":"Tesi di laurea triennale"}]}],"edm:rights":["http:\/\/rightsstatements.org\/vocab\/InC\/1.0\/"],"rdam:P30004":[{"@type":"phaidra:acnumber","@value":"AC17685061"},{"@type":"ids:doi","@value":"10.34876\/1srm-4333"}],"role:assessor":[{"@type":"schema:Person","schema:familyName":[{"@value":"Strobl"}],"schema:givenName":[{"@value":"Birgit"}]}],"role:aut":[{"@type":"schema:Person","schema:familyName":[{"@value":"Korrer"}],"schema:givenName":[{"@value":"Linda"}]}],"role:coadvisor":[{"@type":"schema:Person","schema:familyName":[{"@value":"Szakács"}],"schema:givenName":[{"@value":"Gergely"}]}],"role:dgs":[{"@type":"schema:Person","schema:familyName":[{"@value":"Högler"}],"schema:givenName":[{"@value":"Sandra"}]}],"schema:numberOfPages":["48"]}